18 września 1999 roku trzy Państwa Założycielskie – Dania, Niemcy i Polska – wciągnęły flagi na maszty w siedzibie Wielonarodowego Korpusu Północno-Wschodniego w Szczecinie. Tak zaczęła się historia tej formacji w Szczecinie. Od tamtego czasu Korpus bardzo się rozwinął. W roku 2007 jego personel wziął udział w misji Międzynarodowych Sił Wsparcia Bezpieczeństwa w Afganistanie. Od 2004 roku w Kwaterze Głównej powiewają flagi Estonii, Litwy i Łotwy. W 2005 roku do Korpusu przystąpiły Słowacja i Czechy. Flaga Stanów Zjednoczonych została wciągnięta na maszt w listopadzie 2006. Dwa lata później do Szczecina przybyli oficerowie rumuńscy. W sierpniu 2009 roku do współpracy przystąpiła Słowenia, w 2012 – Chorwacja, w 2013 - Węgry. Szwecja, która nie jest członkiem NATO, przysłała do Koszar Bałtyckich swojego przedstawiciela jesienią 2014. W 2015, służbę rozpoczęli w Szczecinie oficerowie brytyjscy, tureccy, francuscy i holenderscy. Obecnie w Wielonarodowym Korpusie Północno-Wschodnim służą żołnierze z 25 krajów. W 2016 Wielonarodowy Korpus Północno-Wschodni awansował na jednostkę wysokiej gotowości NATO i ma być gotowy do działania w ciągu 48 godzin, odpowiadając na każde zagrożenie. Zgodnie z zaleceniami ze szczytu NATO w walijskim Newport Korpus dowodzi aktualnie nie tylko tzw. szpicą sojuszu, ale także jednostkami koordynacji NATO.