Osoby, które pracowały w organach bezpieczeństwa PRL lub z nimi współpracowały, nie będą mogły być rektorami, dziekanami czy kierownikami katedr na uczelniach. Ministerstwo Nauki i Szkolnictwa Wyższego przygotowało projekt dezubekizacyjny w szkolnictwie wyższym. Według projektu ustawy pracownicy i współpracownicy organów bezpieczeństwa PRL nie będą też mogli pełnić funkcji kierowniczych w Polskiej Akademii Nauk czy Polskiej Komisji Akredytacyjnej. Projekt ustawy zakazuje im też współpracy z tymi instytucjami jako eksperci. Organy bezpieczeństwa PRL, określone w ustawie o IPN to m.in. Ministerstwo Bezpieczeństwa Publicznego, Służba Bezpieczeństwa, jednostki Milicji Obywatelskiej, Informacja Wojskowa, Wojskowa Służba Wewnętrzna czy wywiad wojskowy PRL. Do tej pory osoby pełniące funkcje publiczne w szkolnictwie wyższym miały obowiązek składania oświadczeń lustracyjnych. Jeżeli przyznały się do współpracy z komunistycznym aparatem represji, nadal mogły pełnić swoje funkcje.