Synagoga zbudowana w latach 1873-1875, według projektu szczecińskiego architekta Konrada Krühla, stanęła na miejscu dawnej drewnianej bożnicy.
Podczas "Nocy Kryształowej" z 9 na 10 listopada 1938 naziści zniszczyli wiele żydowskich sklepów i spalili synagogi, m.in tę w przedwojennym Szczecinie, czyli Stettinie.
W 1941 roku jej zgliszcza wysadzono w powietrze i usunięto. Dziś o synagodze przypomina tablica pamiątkowa umieszczona obok budynku Książnicy Pomorskiej. Teraz pamięć wzmocni mural, który powstaje z inicjatywy Towarzystwa Społeczno-Kulturalnego Żydów, dzięki dofinansowaniu Urzędu Marszałkowskiego dla mniejszości narodowych oraz dzięki prywatnemu sponsorowi.