Vavra zaczął eksperymentować z kinem w dwudziestoleciu międzywojennym. W 1937 roku wyreżyserował pierwszy film. Rok później powstała legendarna czeska komedia, zatytułowana "Cech panien kutnohorskich". Za ten obraz reżyser otrzymał Złotego Lwa na Międzynarodowym Festiwalu Filmowym w Wenecji. W pracy twórczej nie przeszkodził Vavrze ani wybuch drugiej wojny światowej, ani nadejście komunistycznej Czechosłowacji.

Krytycy najbardziej cenią takie filmy Vavry, jak "Złota reneta", "Romanca na trąbce" oraz "Młot na czarownice" - wszystkie powstały w latach sześćdziesiątych.

Vavra był wielokrotnie odznaczany, zarówno przez najwyższe władze południowego sąsiada Polski, jak i Czeską Akademię Filmową, która przyznała mu Złotego Lwa za całokształt twórczości.
Vavra uchodzi również za jednego z twórców Wydziały Filmowego i Telewizyjnego w Akademii Muzycznej w Pradze, gdzie wykładał prawie do śmierci.