Ostatnia znana pozycja statku, który płynął z Jacksonville na Florydzie do Puerto Rico, to rejon w pobliżu Crooked Island, w archipelagu Wysp Bahama. Szalał tam wówczas bardzo niebezpieczny huragan Joaquin a jednostka o długości 240 metrów była obciążona kontenerami i samochodami pod pokładem.

Dotychczas Straż Przybrzeżna USA znalazła zwłoki tylko jednego marynarza, który najprawdopodobniej był członkiem załogi "El Faro". Odnaleziono też zniszczoną tratwę ratunkową, kamizelki, koła ratunkowe i kilka kontenerów.

Trwające od sześciu dni poszukiwania nie przyniosły dotychczas żadnych rezultatów. Eksperci od spraw żeglugi ocenili, że była to najtragiczniejsza katastrofa statku płynącego pod banderą USA od ponad 30 lat.