Według Instytutu Pamięci Narodowej, ekonomista rozpracowywał środowisko akademickie. IPN informuje, że ma donosy pisane przez naukowca. Na tej podstawie w maju Sąd Okręgowy w Szczecinie uznał, że profesor skłamał w oświadczeniu lustracyjnym. Zakazał mu pełnić funkcje publiczne i startować w wyborach przez pięć lat.

Stanisław Flejterski nie chciał komentować decyzji sądu, poinformował nas jedynie, że się z nią nie zgadza i chętnie porozmawia z dziennikarzami, gdy zapadnie prawomocny wyrok. Tak może się stać już na pierwszej rozprawie w szczecińskim Sądzie Apelacyjnym, którą zaplanowano 11 września.